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A cidade de Candiota está situada no sudeste do Rio Grande do Sul e possui as maiores reservas de carvão do Brasil. O carvão é extraído de minas a céu aberto, sendo usado localmente na geração de eletricidade pelo maior complexo de energia térmica do Estado (Termoelétrica Presidente Médici). Baccharis trimera (Less.) D.C. (Asteraceae) é uma planta também conhecida como carqueja, que ocorre em Candiota. Esta já foi utilizada em outros estudos demostrando bioacumular componentes inorgânicos relacionados à poluição em Candiota. O objetivo deste estudo foi avaliar mutagenicidade (Teste de Micronúcleos) e genotoxicidade (Ensaio cometa) de extrato aquoso de Baccharis trimera obtida em Candiota (na direção preferencial de ventos, estação inverno) em camundongos.  As amostras de carqueja foram obtidas em diferentes locais: (1) Local 1, plantas coletadas a uma distância de 2,5 km da usina termelétrica; (2) Local 2, Bagé (controle externo), que foi coletado a cerca de 57 km da usina. Também foram realizados controles negativo (água) e positivo (ciclofosfamida, 25 mg/kg). Três concentrações de extratos aquosos foram utilizadas em camundongos (5 machos+5 fêmeas / grupo) por gavagem: C1 (2000 mg/kg), C1/2 (1000 mg/Kg) e C1/4 (500 mg/Kg). Todos os animais receberam tratamento durante 2 dias consecutivos. Para o ensaio de cometa, amostras de sangue periférico foram coletadas de cada animal 3, 6 e 24 horas após a primeira administração. Os animais foram sacrificados por deslocamento cervical após 48 h da primeira dose, quando a medula óssea do fêmur foi amostrado para o ensaio de micronúcleos. Os animais que receberam extrato oriundo de Candiota nas doses C1 e C1/2 (6h) apresentaram valores mais elevados para danos ao DNA pelo ensaio Cometa (índice de dano e freqüência de danos) que o controle negativo e amostra de Bagé (controle externo, P <0,01; ANOVA). As diferenças entre as doses foram também observadas, onde nas maiores doses se verificou maiores efeitos genotóxicos. Para esta amostra ainda observou-se relação com a dosagem de inorgânicos pelo método PIXE. Mutagenicidade não foi observada. Os resultados demonstraram que os extratos de B. trimera coletados na região exposta ao carvão (Candiota) da na estação inverno demonstrou potencial genotóxico comparada aos controles interno e externo (Bagé).